科瑞恩特

空间转录组学

技术背景

       10X Visium HD系统可以将普通FFFFPE组织切片HE染色、免疫荧光染色后的目的区域转录组分析物,转移到Visium玻片上,保留组织切片的空间转录组信息,通过生物信息学分析组织空间细胞组成、空间基因表达、空间细胞间通讯,发掘新的生物标志物。

技术平台

        空间转录组学检测平台是基于10X Visium HD的检测系统,在Visium HD芯片的6.5mmX6.5mm的区域,包含了大约1100万个2μm x 2μm的 barcoded square,每个barcoded square作为一个亚细胞级别的独特spatial barcode,允许将基因表达数据映射回特定的square,将切片转录组空间信息映射到Visium芯片中,通过反转录、建库和测序分析获得样本的转录组空间信息。

 

检测流程

 

平台优势

 

 

应用领域

 

样本类型及要求

接受样本类型
新鲜冷冻组织
石蜡组织/石蜡切片
样本要求
组织形态学检测:冰冻切片或石蜡切片,普通 H&E 染色,样本符合客户研究目的,组织形态上完整,无大的裂痕、冰晶形成而产生的空泡、褶皱等。
RNA 完整性检测:切片提取 RNA,Agilent 2100检测 RIN 值,理想情况下 RNA RIN 值应大于4。