单细胞多组学
技术背景
单细胞多组学技术是以单个细胞作为研究对象分析单细胞内基因表达和膜表面蛋白表达,通过Barcoded磁珠标记单细胞后进行反转录、扩增建库和测序,利用生物信息学对单细胞的转录组测序数据分析,获得单细胞的基因表达谱和膜表面蛋白表达信息,对细胞亚群进行聚类、信号通路富集分析等。
技术平台
单细胞检测平台基于 BD Rhapsody 单细胞上样工作站和Scanner成像仪组成。利用多孔芯片将单细胞悬液自然沉降到微孔中分离成单个细胞,多组学试剂盒对单细胞标记后,裂解、反转录和扩增,获得转录组库、VDJ免疫组库、ATAC文库;将平台独特的寡核苷酸标记Ab-seq抗体提前孵育单细胞,对寡核酸序列扩增、建库和其他文库一起NGS测序,进行单细胞转录组和膜蛋白表达分析,实现多组学检测。
检测项目
- 单细胞全转录组测序分析(scRNA-seq )
- 单细胞免疫组库检测(BCR/TCR)
- 单细胞核染色质可及性检测(snATAC-seq)
- 单细胞多组学测序分析(转录组+膜蛋白+免疫组库+ snATAC库)
检测流程
平台优势
实现单细胞多组学一站式检测
单通道超过20万个微孔,单次最高可上样6万个单细胞,捕获率高,有利于稀有亚群检出
细胞自然沉降到微孔中完成单细胞分离,对细胞损伤小,适合中性粒等脆弱细胞检测
利用SMK标签,区分不同组单细胞,一次上样可进行多样本分离,减少样本组间操作造成的差异
应用领域
样品要求
单细胞上机满足要求
- 细胞直径小于40µm(大于40µm需要分离单细胞核);
- 单细胞悬液活率大于80%;
- 细胞数大于2X105 ;
体液、组织等详细取样送样要求见《单细胞测序服务指南》